Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Rtf1A2AQ19 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Rtf1A2AQ19 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Rtf1A2AQ19 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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