Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms