Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ckap5A2AGT5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ckap5A2AGT5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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