Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms