Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

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Length 1,946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Chd5A2A8L1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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