Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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