Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PdfS4R2K0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms