Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubl3Q9Z2M6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubl3Q9Z2M6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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