Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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