Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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