Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms