Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip2Q9Z0H8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clip2Q9Z0H8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms