Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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