Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms