Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms