Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms