Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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