Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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