Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Rabgef1Q9JM13 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rabgef1Q9JM13 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rabgef1Q9JM13 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rabgef1Q9JM13 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rabgef1Q9JM13 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rabgef1Q9JM13 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rabgef1Q9JM13 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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