Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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CtsmQ9JL96 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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CtsmQ9JL96 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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CtsmQ9JL96 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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CtsmQ9JL96 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CtsmQ9JL96 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CtsmQ9JL96 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsmQ9JL96 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsmQ9JL96 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms