Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Mrpl39Q9JKF7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mrpl39Q9JKF7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mrpl39Q9JKF7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mrpl39Q9JKF7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mrpl39Q9JKF7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mrpl39Q9JKF7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Mrpl39Q9JKF7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Mrpl39Q9JKF7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms