Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rb1cc1Q9ESK9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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Rb1cc1Q9ESK9 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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Rb1cc1Q9ESK9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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Rb1cc1Q9ESK9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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Rb1cc1Q9ESK9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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Rb1cc1Q9ESK9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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Rb1cc1Q9ESK9 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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Rb1cc1Q9ESK9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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Rb1cc1Q9ESK9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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