Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms