Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms