Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc97Q9DBT3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms