Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms