Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnn3Q9DAW9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms