Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V3

Echdc1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc1Q9D9V3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Echdc1Q9D9V3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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