Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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