Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms