Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg7Q9D906 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg7Q9D906 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms