Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9D8L0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms