Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn23Q9D7D7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn23Q9D7D7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn23Q9D7D7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn23Q9D7D7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn23Q9D7D7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn23Q9D7D7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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