Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Nop56Q9D6Z1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Nop56Q9D6Z1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Nop56Q9D6Z1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nop56Q9D6Z1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nop56Q9D6Z1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nop56Q9D6Z1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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