Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2al3Q9D4U4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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