Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt20Q9D312 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms