Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hddc3Q9D114 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms