Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zbed3Q9D0L1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zbed3Q9D0L1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms