Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rfc5Q9D0F6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rfc5Q9D0F6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms