Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms