Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms