Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mis12Q9CY25 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.4 ms