Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms