Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pard3bQ9CSB4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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