Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg12Q9CQY1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms