Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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