Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CQC3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q9CQC3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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