Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 AC164612.2-201ENSMUST00000215737 719 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CQ90 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms