Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Use1Q9CQ56 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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