Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim26Q99PN3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Trim26Q99PN3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim26Q99PN3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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